Durante la lunghissima carriera da professionista di Marco Ballotta, la parentesi tra le fila del Parma è di sicuro positiva e vincente. Nelle sue tre stagioni in gialloblu, infatti, riesce a vincere 1 Coppa Italia e 1 Coppa delle Coppe, regalandosi anche una notte da protagonista assoluto nella finale vinta a Wembley contro l’Anversa.

Si ritira dal calcio professionistico nel 2008, dopo essere diventato il calciatore più anziano ad aver disputato una partita di Serie A (44 anni e 38 giorni) e di Champions League (43 anni e 253 giorni).